El Rector de la Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa, Dr. Hugo Rojas, mediante Resolución Rectoral 1540-2024 del 30 de diciembre del 2024, aprobó el presupuesto institucional de apertura del año fiscal 2025 que asciende a un total de 391 millones 963 mil 548 soles.

El gasto corriente es de 317 millones 168 mil 673 soles, mientras que los gastos de capital son de 74 millones 794 mil 875 soles. Los recursos ordinarios ascienden a 230 millones 952 mil 557 soles, los recursos directamente recaudados son de 55 millones 524 mil 482 soles, las donaciones y transferencias es de 12 millones 051 mil 482 soles, mientras que los recursos determinados son de 93 millones 435 mil 343 soles.

Según la UNSA, el año presupuestal 2024, logró un avance del 99.3 % de su presupuesto que ascendió a los 384 millones de soles según datos del portal Consulta Amigable del Ministerio de Economía y Finanzas (MEF), destacándose como una institución que optimiza el uso de sus recursos para alcanzar objetivos académicos, administrativos y de investigación.