El gobierno regional de Arequipa, es uno de los veinticinco gobiernos regionales que menos ejecución presupuestal tiene de los recursos transferidos por el gobierno nacional por el fenómeno del niño al 19 de noviembre, ya que solo ejecutó el 18.9% de los 3 millones 709 mil 934 soles presupuestados, según el portal de transparencia económica del Ministerio de Economía y Finanzas. El gobierno nacional presupuesto para los veinticinco gobiernos regionales un total de 402 millones 348 mil 539 soles, pero en promedio a nivel nacional solo han ejecutado el 25.7%, según el MEFC.

Tres son los gobiernos regionales que más ejecución presupuestal tienen al mes de noviembre. Ellos son, el gobierno regional de Loreto con una ejecución del 58.6% y con un presupuesto de 8 millones 288 mil soles, el gobierno regional de San Martin con una ejecución del 58.1% con un presupuesto de 8 millones 873 mil soles, el gobierno regional de Huánuco con una ejecución presupuestal del 54.5% y un presupuesto de 4 millones 878 mil soles.

Los tres gobiernos regionales que menos ejecución presupuestal por el fenómeno del niño son tres. Ellos son, el gobierno regional de Moquegua con 0.0% de un presupuesto transferido de 581 mil 828 soles, el gobierno regional de Puno con una ejecución presupuestal del 0.4% y con un presupuesto de 2 millones 706 mil soles, mientras que el gobierno regional de Lima tiene una ejecución presupuestal de 5.8% con un presupuesto de 89 millones 544 mil soles.